台灣基督長老教會是普世長老教會及改革宗教會大家庭的一份子。它的歷史根源,可以上溯至臺灣三大西方醫療傳道之濫觴,此即公元1865年英國長老教會宣教師馬雅各醫生在南部之宣教,及公元1872年加拿大長老教會宣教師馬偕博士在北部所開展的宣教工作,及公元1896年英國基督長老教會宣教師梅堅霧與蘭大衛在彰化進行醫療傳道事工。