萬芳醫院所地是昔日「萬隆」與「芳川」兩礦場，
「萬芳」之名由此而來。自 1989 年動工興建，
1996 年7月由臺北市政府委託臺北醫學大學籌設經
營，於 1997年2月15日正式開幕服務市民，為臺北
市第一家公辦民營的市立醫院並於 1998年2月通過
區域醫院評鑑，4月榮獲市立醫院經營績效評比第
一名， 12月通過 ISO-9002 國際品質認証。臺北市
第一家公辦民營醫院台北市政府為減少每年新台幣
五億元的公務預算支出，及藉助民間機構經營效
率，決定將萬芳醫院委託民間經營。歷經多次審慎
的公告招標，台北市政府同意將台北市第一家公辦
民營醫院委託 給臺北醫學大學經營。